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我校亚寒带生物多样性尝试室在水稻基因组布局变异研讨中取得新停顿

宣布者:gaoyun宣布时候:2020-11-04阅读次数:10

     我校亚寒带生物多样性尝试室寇一翾博士与美国加州大学欧文分校的迷信家协作,在水稻群体退化基因组学研讨方面取得新停顿,研讨功效以亚洲稻驯化中布局变异的演变基因组研讨(Evolutionary Genomics of Structural Variation in Asian Rice (Oryza sativa) Domestication为题,于2020718日在《份子生物与退化》(Molecular Biology and Evolution)上在线颁发。寇一翾博士为该文第一作者。

    布局变异作为基因组变异的首要构成局部,对动物表型变异发生了庞大的影响,并在出产理论中取得了普遍的利用,但是从群体基因组程度上深度揭露其变更纪律的研讨甚少。该文以亚洲种植稻Oryza sativa与其野生先人种O. rufipogon为研讨工具,基于基因组重测序数据(347份资料),和三代和组装基因组数据,判定了水稻群体基因组程度上的布局变异,包含倒位、反复、删除、易位,和转座元件;经由进程位点频谱变更纪律和遗传负荷阐发,揭露布局变异感化于水稻的驯化本钱(domestication cost),并首要以无害渐变的情势存在,特别是倒位和转座元件SINEmariner家属;另外,经由进程比拟基因组阐发发明,在水稻驯化进程中经由进程布局变异取得和丧失数百个基因,在一些明显分解的布局变异中还富集了一批与首要的农艺性状相干的基因。该研讨不只对水稻遗传育种具备首要的指点意思,同时也为动物驯化相干的研讨,和动物群体退化基因组学研讨供给新的研讨思绪。

    我校亚寒带生物多样性尝试室自2007年建立以来,前后承当科研名目20余项,此中国度天然迷信基金15项,在Molecular Biology and Evolution等国际闻名学术刊物上颁发相干研讨功效近30篇,获2019年度江西省天然迷信一等奖,为我校动物学、生态学和林学等学科成长供给了支持。


文章链接:http://academic.oup.com/mbe/advance-article/doi/10.1093/molbev/msaa185/5873527?searchresult=1

        

供稿:农学院  考核:科技处


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